Metatranscriptómica
La metatranscriptómica és una disciplina que estudia l'expressió gènica dels microbis en entorns naturals, és dir, el metatranscriptoma. També permet obtindre perfils complets d'expressió gènica de comunitats microbianas complexes.[1]
Mentres la metagenómica s'enfoca en estudiar el material genètic i en identificar microbis que estan presents dins d'una comunitat, la metatranscriptómica pot usar-se per a estudiar la diversitat de genés actius en dita comunitat, per a quantificar els seus nivells d'expressió i monitorear cóm estos nivells canvien en diferents condicions (per eixemple, condicions fisiològiques front a patològiques en un organisme). La ventaja de la metatranscriptómica és que pot proporcionar informació sobre les diferències en les funcions actives de les comunitats microbianas que semblen ser les mateixes en térmens de composició microbiana.[2]
Introducció
[editar | editar còdic]El microbioma s'ha definit com una comunitat microbiana que ocupa un hàbitat ben definit. Són ubics i extremadament rellevants per al manteniment de la característica de l'entorn en el que residixen i un desequilibri en estes comunitats pot afectar negativament l'activitat de l'entorn en el que residixen. Per a estudiar estes comunitats, i després determinar el seu impacte i correlació en la seua caseta, diferents ómicas s'han utilisat enfocaments. Mentres que la metagenómica permet obtindre un perfil taxonómico de la mostra, la metatrascriptómica proporciona un perfil funcional en analisar qué gens són expressats per la comunitat. És possible inferir quins gens s'expressen en condicions específiques, i açò es pot fer utilisant anotacions funcionals de gens expressats.[3]
Funcions
[editar | editar còdic]Ya que la metatranscriptómica se centra en quins gens s'expressen, permet comprendre el perfil funcional actiu de tota la comunitat microbiana. La descripció general de l'expressió gènica en una mostra determinada s'obté capturant l'ARNm total del microbioma i realisant una seqüenciació completa de metatranscriptómica.[4]
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ “Functional signatures of oral dysbiosis during periodontitis progression revealed by microbial metatranscriptome analysis.” . Genome Medicine 7 (1): 27. doi:. PMID 25918553.
- ↑ “Use of Metatranscriptomics in Microbiome Research” . Bioinformatics and Biology Insights 10: 19–25. doi:. PMID 27127406.
- ↑ Mycoparasitism and Plant Disease Control., Manchester, UK: Manchester University Press, pp. 161–87.
- ↑ Microbe Magazine.4(7)
- 329–335.ISSN 1558-7452.doi:10.1128/microbe.4.329.1.Consultat el 2021-08-15.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Metatranscriptómica» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.