Anar al contingut

Sentit (biologia molecular)

De L'Enciclopèdia, la wikipedia en valencià

En biologia molecular i genètica, el sentit de les molècules d'àcit nucleico (a sovint ADN o ARN) és la naturalea de les seues funcions i les funcions de les seues unitats d'àcit nucleico de les molècules complementàries en l'especificació d'aminoàcits. Depenent del context dins de la biologia molecular, el sentit pot tindre significats llaugerament diferents.

Sentit de el ADN

[editar | editar còdic]

Els biòlecs moleculars criden a una sola cadena de sentit de el ADN (o positiu (+)) si una versió de ARN de la mateixa seqüència es traduïx en proteïna. El seu cadena complementària es diu antisentido (o sentit negatiu (-) ). A voltes es troben les frases que codifiquen cadenes (sentit) i plantilla de cadena (antisentido); no obstant, els ARN codificantes i no codificantes de proteïnes poden transcribirse a partir de la cadena sentit. Ademés, els térmens "sentit" i "antisentido" són relatius a la transcripció de ARN en qüestió i no a la cadena de ADN en el seu conjunt. En atres paraules, qualsevol de les cadenes de ADN pot servir com a cadena sentit o antisentido per a una transcripció de ARN particular. En alguns casos, les transcripcions de ARN poden transcribirse en abdós direccions (és dir, en qualsevol de les cadenes) des d'una regió promotora comuna, o poden transcribirse des de dins dels intrones en qualsevol de les cadenes.[1][2][3]

ADN antisentido

[editar | editar còdic]

Les dos cadenes complementàries de ADN bicatenario (ADNds) generalment es diferencien com la cadena "sentit" i la cadena "antisentido". La cadena de sentit de el ADN s'assembla al ARN mensager (ARNm) i pot usar-se per a llegir el còdic de proteïna esperat; per eixemple, ATG en el sentit de ADN pot correspondre a un codón AUG en el ARNm, que codifica l'aminoàcit metionina. No obstant, la cadena de sentit de el ADN en sí mateixa no s'usa per a produir proteïnes en la cèlula. És la cadena antisentido de ADN que servix com a font del còdic de la proteïna, perque, en bases complementàries a la cadena de sentit de el ADN, s'usa com a plantilla per a el ARNm. Ya que la transcripció dona com resultat un producte de ARN complementari a la cadena mòle de ADN, el ARNm és complementari a la cadena antisentido de ADN. El ARNm és lo que s'usa per a la traducció (síntesis de proteïnes).

Archiu:Antisense caps block 36 oligonucleotide.png
Esquema que mostra cóm les cadenes de ADN antisentido poden interferir en la traducció de proteïnes.

Per lo tant, un triplet de base 3'-TAC-5 'en la cadena antisentido de ADN es pot usar com a plantilla que donarà com resultat un triplet de base 5'-AUG-3' en ARNm (AUG és el codón per a la metionina, el codón d'inici). La cadena de sentit de el ADN tindrà el triplet ATG, que s'assembla a AUG pero no s'usarà per a produir metionina perque no s'usarà per a produir ARNm. La cadena de sentit de el ADN es diu cadena de "sentit" no perque s'usarà per a produir proteïnes (no ho serà), sino perque té una seqüència que s'assembla a la seqüència del codón de la proteïna.

En biologia i investigació, les molècules antisentido curtes poden interactuar en cadenes complementàries d'àcits nucleicos, modificant l'expressió de gens.

Eixemple en ADN bicatenario

[editar | editar còdic]

Cadena de ADN 1: cadena antisentido (transcrita a) → cadena de ARN (sentit)

Cadena de ADN 2: cadena sensorial

Algunes regions dins d'una doble cadena d'ADN codifiquen gens, que generalment són instruccions que especifiquen l'orde dels aminoàcits en una proteïna junt en seqüències reguladores, llocs d'empalme, intrones no codificantes i atres detalls complicats. Per a que una cèlula use esta informació, una cadena de el ADN servix com a plantilla per a la síntesis d'una cadena complementària d'ARN. La cadena de ADN de plantilla es diu cadena transcrita en seqüència antisentido i es diu que el transcrito de ARNm és seqüència de sentit (el complement de antisentido). Degut a que el ADN és bicatenario, la cadena complementària a la seqüència antisentido es diu cadena no transcrita i té la mateixa seqüència de sentit que el transcrito de ARNm (encara que les bases T en el ADN estan substituïdes en bases O en el ARN).

3'CGCTATAGCGTTT   5' Cadena antisentido de ADN (plantilla/no codificació) Utilisat com a plantilla per a la transcripció.
5'GCGATATCGCAAA   3' Cadena de sentit de el ADN (sense plantilla/codificació) Complementari a la secció de la plantilla.
5'GCGAUAUCGCAAA   3' transcripció de sentit de ARNm Cadena de ARN que es transcribe de la cadena no codificante (plantilla / antisentido).

Nota1 : Llevat pel fet de que totes les timinas són ara uracilos (T -> O), és complementari a la cadena de ADN no codificante (plantilla / antisentido) ( idèntica a la cadena de ADN codificante (no plantilla / sentit)).

3'CGCUAUAGCGUUU   5' transcripció antisentido de ARNm Cadena de ARN que es transcribe de la cadena de codificació (no plantilla / sentit).

Nota: Llevat pel fet de que totes les timinas són ara uracilos (T -> O), és complementari a la cadena de ADN codificante (no plantilla / sentit) ( idèntica a la cadena de ADN no codificante (plantilla / antisentido)).

Una nota sobre la confusió entre les cadenes de "sentit" i "antisentido": els noms de les cadenes realment depenen de la direcció en la que està escrivint la seqüència que conté l'informació per a les proteïnes (l'informació de "detecció"), no en quina cadena està en la part superior o inferior (que és arbitrari). L'única informació biològica real que és important per a marcar bri és l'ubicació del grup fosfat 5 'i el grup hidroxilo 3' perque estos extrems determinen la direcció de transcripció i traducció. Una seqüència 5 'CGCTAT 3' és equivalent a una seqüència escrita 3 'TATCGC 5' sempre que s'anoten els extrems 5 'i 3'. Si els extrems no estan etiquetats, la convenció és supondre que la seqüència s'escriu d'esquerra a dreta en la direcció de 5 'a 3'. El bri de Watson es referix al bri superior de 5 'a 3' (5 '→ 3'), mentres que el bri Crick es referix al bri inferior de 5 'a 3' (3 '← 5').[4] Les cadenes de Watson i Crick poden ser cadenes sentit o antisentido depenent del gen les seqüències del qual es mostren en la base de senyes de seqüències del genoma. Per eixemple, YEL021W, un àlies del gen URA3 utilisat en la base de senyes de NCBI, definix que este gen es troba en el 21 ° marc de llectura obert (ORF) del centrómero del braç esquerre (L) del número de cromosoma V (I) del rent (I) ), i que la cadena de codificació d'expressió és la cadena de Watson (W). YKL074C definix el 74.º ORF a l'esquerra del centrómero del cromosoma XI i denota la cadena de codificació de la cadena de Crick (C). Un atre terme confús que es referix al filament "més" i "menys" també s'usa àmpliament. Si la cadena és sentit (positiu) o antisentido (negatiu), la seqüència de consulta predeterminada en l'alliniació de NCBI BLAST és la cadena "Plus".

Ambisentido

[editar | editar còdic]

Es diu que un genoma monocatenario que conté sentit positiu i sentit negatiu és ambisentido. Els bunyavirus tenen 3 fragments de ARN monocatenario (ARNss), alguns dels quals contenen seccions en sentit positiu i negatiu; els arenavirus també són virus ARNss en un genoma ambisentido, ya que tenen 2 fragments que són principalment de sentit negatiu, llevat per part dels extrems 5 'dels segments grans i menuts del seu genoma.


Referències

[editar | editar còdic]
  1. ↑ (2003).Virus Research.93(2)
    141–150.doi:10.1016/S0168-1702(03)00094-7.
  2. ↑ (1991).J Gen Virol.72(2)
    465–8.doi:10.1099/0022-1317-72-2-465.
  3. ↑ (1991).J Gen Virol.72(4)
    763–7.doi:10.1099/0022-1317-72-4-763.
  4. ↑ Biology Direct.6
    7.doi:10.1186/1745-6150-6-7.
Obtingut de «https://www.lenciclopedia.org/w/index.php?title=Sentit_(biologia_molecular)&oldid=753607»