StarBase (base de senyes biològica)
StarBase és una base de senyes biològica[1] per a decodificar Micro ARN - ARN mensager , Long senar-coding RNA,[2] Micro ARN - sncRNA , Micro ARN-Circular RNA, Micro ARN - Pseudogén, proteïna-Long senar-coding RNA,[3] proteïna-ARN no codificante, interacciones proteïna-ARN mensager i rets ceRNA de CLIP-Seq ( HITS-CLIP , PAR-CLIP , iCLIP , CLASH)[4] i senyes de seqüenciació degradome.[5]
Informació
[editar | editar còdic]StarBase proporciona ferramentes web miRFunction i ceRNAFunction[6] per a predir la funció d'ARN no codificante (Micro ARN,[7] Long senar-coding RNA, Pseudogén)[8] i gens que codifiquen proteïnes de les rets reguladores de Micro ARN i ceRNA .[4] StarBase també va desenrollar Pa-Cancer Analysis Platform per a dessifrar les rets d'anàlisis Pa-Cancer de lncRNA, miRNA, ceRNA i proteïnes d'unió a ARN (RBP) per mig de l'extracció de perfils clínics i d'expressió de 14 tipos de càncer (incloses més de sis mil mostres) del Portal de senyes de l'Atles del genoma del càncer (TCGA) .[9]
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Nucleic Acids Research.39(Database issue)
- D202–D209.ISSN 0305-1048.doi:10.1093/nar/gkq1056.Consultat el 2021-05-31.
- ↑ https://academic.oup.com/nar/article/39/suppl_1/D202/2506133
- ↑ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21037263/
- ↑ 4,0 4,1 «ENCORI: The Encyclopedia of RNA Interactomes.». starbase.sysu.edu.cn. Consultat el 2021-05-31.
- ↑ «Copia archivada». Archivat des d'el original, el 22 de setembre de 2013. Consultat el 31 de maig de 2021.
- ↑ «Copia archivada». Archivat des d'el original, el 22 de setembre de 2013. Consultat el 31 de maig de 2021.
- ↑ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3964941
- ↑ «Pa-Cancer ceRNA Regulatory Network. starBase: decoding miRNA-target, miRNA-ceRNA and protein-RNA interaction maps from CLIP-Seq(PAR-CLIP, HITS-CLIP, iCLIP, CLASH) data». web.archive.org. Archivat des d'el original, el 15 de març de 2014. Consultat el 2021-05-31.
- ↑ «starBase: A database for exploring miRNA-mRNA interaction maps from CLIP-Seq and Degradome-Seq data». web.archive.org. Archivat des d'el original, el 22 de febrer de 2011. Consultat el 2021-05-31.
- Este artícul conté una traducció derivada de «StarBase (base de datos biológica)» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.