DbSNP
La base de senyes de polimorfisme d'un sol nucleòtit[1] (dbSNP) és un archiu públic gratuït per a la variació genètica dins i entre diferents espècies desenrollat i estajat pel Centre Nacional d'Informació Biotecnológica (NCBI) en colaboració en l'Institut Nacional d'Investigació del Genoma Humà (NHGRI). Encara que el nom de la base de senyes implica una colecció d'una sola classe de polimorfisme (és dir, polimorfisme d'un sol nucleòtit (SNP), de fet conté un ranc de variació molecular:
- (1) SNP ,
- (2) polimorfisme curts de deleción i inserció ( indeles / DIP ),
- (3) marcadors microsatélites o repeticions curtes en tàndem (STRs),
- (4) polimorfisme multinucleótidos (MNPs),
- (5) seqüències heterocigotas, i
- (6) variants nomenades.
El dbSNP accepta polimorfisme aparentment neutrals, polimorfisme corresponents a fenotips coneguts, i regions sense variació. Es va crear en setembre de 1998 per a complementar GenBank, la colecció de seqüències d'àcits nucleicos i proteïnes disponibles públicament de el NCBI.[2]
En 2017, NCBI va deixar de brindar soport per a tots els organismes no humans en dbSNP.[3] A partir de la versió 153 (publicada en agost de 2019), dbSNP havia acumulat casi 2 mil millons de presentacions que representen més de 675 millons de variants distintes per a el Homo sapiens.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Nucleic Acids Research.35(Database issue)
- D5–12.ISSN 1362-4962.doi:10.1093/nar/gkl1031.Consultat el 2025-08-28.
- ↑ Genome Research.9(8)
- 677–679.ISSN 1088-9051.doi:10.1101/gr.9.8.677.Consultat el 2025-08-28.
- ↑ «Phasing out support for senar-human genome organism data in dbSNP and dbVar» (en en-us). NCBI Insights. Consultat el 2025-08-28.
- Este artícul conté una traducció derivada de «DbSNP» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.