Ligasa

En bioquímica, una ligasa és una enzima que pot catalizar l'unió (lligam) de dos molèculas grans formant un nou enllaç químic. Açò és típicament a través de la hidrólisis d'un chicotet grup químic colgante en una de les molècules més grans o l'enzima que cataliza l'unió de dos composts, per eixemple, enzimes que catalizan l'unió de CO, CS, CN, etc. En general, una ligasa cataliza l'unió de dos composts. següent reacció:

Ab + C → A–C + b o algunes voltes

Ab + cD → A–D + b + c + d + i + f a on les lletres minúscules poden significar els menuts grups depenents. La ligasa pot unir dos fragments complementaris d'àcit nucleico i reparar trencaments monocatenarias que sorgixen en el ADN bicatenario durant la replicació.^[1]

Nomenclatura

El nom comú de les enzimes ligasa també inclouen l'ADN ligasa, una enzima comunament utilisada en els laboratoris de biologia molecular per a unir fragments d'ADN. Atres noms comuns per a les ligasas inclouen la "sintetasa", perque s'utilisen per a sintetisar noves molècules.

La nomenclatura bioquímica a voltes ha distinguit les sintetasas de les sintasas i, a voltes, ha tractat les paraules com a sinònims. Segons una definició, les sintasas no usen energia dels nucleòsits trifosfatos (com ATP, GTP, CTP, TTP i UTP), mentres que les sintetasas sí usen nucleòsits trifosfatos. També es diu que una sintasa és una liasa (una liasa és una enzima que cataliza la ruptura de varis enllaços químics per mijos distints a la hidrólisis i l'oxidació, a sovint formant un nou doble enllaç o una nova estructura d'anell) i no requerix energia, mentres que una sintetasa és una ligasa (una ligasa és una enzima que unix dos substàncies químiques o composts) i, per lo tant, requerix energia. no obstant, la Comissió Conjunta de Nomenclatura Bioquímica (JCBN) dicta que "sintasa" es pot usar en qualsevol enzima que catalice la síntesis (ya siga que use o no nucleòsit trifosfato), mentres que "sintetasa" es deu usar com a sinònim.

Categoria EC 6.1 (forma enllaços C-O)

EC 6.1.1 ligasas formadores de Aminoacil-tARN o composts relacionats

EC 6.1.1.1 tirosina—tARN ligasa

EC 6.1.1.2 triptófano—tARN ligasa

EC 6.1.1.3 treonina—tARN ligasa

EC 6.1.1.4 leucina—tARN ligasa

EC 6.1.1.5 isoleucina—tARN ligasa

EC 6.1.1.6 lisina—tARN ligasa

EC 6.1.1.7 alanina—tARN ligasa

EC 6.1.1.8 eliminada

EC 6.1.1.9 valina—tARN ligasa

EC 6.1.1.10 metionina—tARN ligasa

EC 6.1.1.11 serina—tARN ligasa

EC 6.1.1.12 aspartato—tARN ligasa

EC 6.1.1.13 D-alanina-poli(fosforibitol) ligasa

EC 6.1.1.14 glicina—tARN ligasa

EC 6.1.1.15 prolina—tARN ligasa

EC 6.1.1.16 cisteína—tARN ligasa

EC 6.1.1.17 glutamato—tARN ligasa

EC 6.1.1.18 glutamina—tARN ligasa

EC 6.1.1.19 arginina—tARN ligasa

EC 6.1.1.20 fenilalanina—tARN ligasa

EC 6.1.1.21 histidina—tARN ligasa

EC 6.1.1.22 asparagina—tARN ligasa

EC 6.1.1.23 aspartato—tARN^Asn ligasa

EC 6.1.1.24 glutamato—tARN^Gln ligasa

EC 6.1.1.25 eliminada

EC 6.1.1.26 pirrolisina—tARN^Pyl ligasa

EC 6.1.1.27 O-fosfoserina—tARN ligasa

EC 6.1.1.28 eliminada

EC 6.1.2 àcit—alcohol ligasas (ester sintasas)

EC 6.1.2.1 D-alanina—(R)-lactato ligasa

EC 6.1.2.2 nebramicina 5' sintasa

EC 6.1.3 cicle-ligasas

EC 6.1.3.1 olefina β-lactona sintetasa

Categoria EC 6.2 (forma enllaços C-S)

EC 6.2.1 Àcit-tiol ligasas

EC 6.2.1.1 acetat—CoA ligasa

EC 6.2.1.2 CoA ligasa de àcit de cadena mija

EC 6.2.1.3 de cadena llarga-gras-acid—CoA ligasa

EC 6.2.1.4 succinato—CoA ligasa (GDP-formador)

EC 6.2.1.5 succinato—CoA ligasa (ADP-formador)

EC 6.2.1.6 glutarato—CoA ligasa

EC 6.2.1.7 colato—CoA ligasa

EC 6.2.1.8 oxalato—CoA ligasa

EC 6.2.1.9 malato—CoA ligasa

EC 6.2.1.10 àcit—CoA ligasa (GDP-formador)

EC 6.2.1.11 biotina—CoA ligasa

EC 6.2.1.12 4-cumarato—CoA ligasa

EC 6.2.1.13 acetat—CoA ligasa (ADP-formador)

EC 6.2.1.14 6-carboxihexanoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.15 araquidonato—CoA ligasa

EC 6.2.1.16 acetoacetato—CoA ligasa

EC 6.2.1.17 propionato—CoA ligasa

EC 6.2.1.18 citrato—CoA ligasa

EC 6.2.1.19 proteïna ligasa de àcit grassos de cadena llarga

EC 6.2.1.20 [proteïna acarreadora de acilos] ligasa de àcit grassos de cadena llarga

EC 6.2.1.21 eliminada, transferida a EC 6.2.1.30

EC 6.2.1.22 [citrato (pro-3S)-liasa] ligasa

EC 6.2.1.23 dicarboxilate—CoA ligasa

EC 6.2.1.24 fitanato—CoA ligasa

EC 6.2.1.25 benzoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.26 o-succinilbenzoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.27 4-hidroxibenzoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.28 3α,7α-dihidroxi-5β-colestanato—CoA ligasa

EC 6.2.1.29 eliminada, transferida a EC 6.2.1.7

EC 6.2.1.30 fenilacetato—CoA ligasa

EC 6.2.1.31 2-furoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.32 antranilato—CoA ligasa

EC 6.2.1.33 4-clorobenzoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.34 trans-feruloil-CoA sintasa

EC 6.2.1.35 acetat—[proteïna acarreadora de acilos] ligasa

EC 6.2.1.36 3-hidroxipropionil-CoA sintasa

EC 6.2.1.37 3-hidroxibenzoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.38 (2,2,3-trimetil-5-oxociclopent-3-enil)acetil-CoA sintasa

EC 6.2.1.39 [butirosina-proteïna acarreadora de acilos]—L-glutamato ligasa

EC 6.2.1.40 4-hidroxibutirato—CoA ligasa (formadora de AMP)

EC 6.2.1.41 3-[(3aS,4S,7aS)-7a-metil-1,5-dioxo-octahidro-1H-inden-4-il]propanoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.42 3-oxocolest-4-en-26-oato—CoA ligasa

EC 6.2.1.43 2-hidroxi-7-metoxi-5-metil-1-naftoato—CoA ligasa

EC 6.2.1.44 3-(metiltio)propionil—CoA ligasa

EC 6.2.1.45 enzima activadora de ubiquitina I₁

EC 6.2.1.46 L-alo-isoleucina:holo-[proteïna acarreadora de CmaA peptidilo] ligasa

EC 6.2.1.47 [acil-carrier-proteïna ] ligasa de àcit grassos de cadena mija

EC 6.2.1.48 carnitina-CoA ligasa

EC 6.2.1.49 adenililtransferasa FadD28 d'àcit gras de cadena llarga

EC 6.2.1.50 4-hidroxibenzoato adenililtransferasa FadD22

EC 6.2.1.51 4-hidroxifenilalcanoato adenililtransferasa FadD29

EC 6.2.1.52 luciferina de Lampyris—CoA ligasa

EC 6.2.1.53 L-prolina—[proteïna acarreadora de L-prolilos] ligasa

EC 6.2.1.54 D-alanina—[proteïna acarreadora de D-alanilos] ligasa (26 d'abril de 2018)

EC 6.2.1.55 enzima activadora de E1 SAMP

EC 6.2.1.56 4-hidroxibutirato—CoA ligasa (ADP-formador)

EC 6.2.1.57 adenilasa/transferasa FadD23 àcit gras de cadena llarga

EC 6.2.1.58 isoftalato—CoA ligasa

EC 6.2.1.59 adenilasa/transferasa FadD26 d'àcit gras de cadena llarga

EC 6.2.1.60 marinolato—CoA ligasa

Categoria EC 6.3 (forma enllaços C-N)

EC 6.3.1 àcit-amoniaco (o amina) ligasas (amida sintasas)

EC 6.3.1.1 aspartato—amonia ligasa

EC 6.3.1.2 glutamina sintetasa

EC 6.3.1.3 eliminada, transferida a EC 6.3.4.13

EC 6.3.1.4 aspartato—amoni ligasa (formador de ADP)

EC 6.3.1.5 NAD⁺ sintasa

EC 6.3.1.6 glutamato—etilamina ligasa

EC 6.3.1.7 4-metileneglutamato—amonia ligasa

EC 6.3.1.8 glutationilspermidina sintasa

EC 6.3.1.9 tripanotiona sintasa

EC 6.3.1.10 adenosilcobinamida-fosfat sintasa

EC 6.3.1.11 glutamato—putrescina ligasa

EC 6.3.1.12 D-aspartato ligasa

EC 6.3.1.13 L-cisteína:1D- mio-inositol 2-amino-2-desoxi-α-D-glucopiranósido ligasa

EC 6.3.1.14 diftina—amonia ligasa

EC 6.3.1.15 8-desmetilnovobiocato sintasa

EC 6.3.1.16 eliminada, transferida a EC 6.3.3.6

EC 6.3.1.17 β-citrilglutamato sintasa

EC 6.3.1.18 γ-glutamilanilida sintasa

EC 6.3.1.19 procarionte ubiquitina-like proteïna ligasa

EC 6.3.1.20 lipoato—proteïna ligasa

EC 6.3.2 ligasas d'aminoàcits (pèptid sintasas)

EC 6.3.2.1 pantoato—β-alanina ligasa (formadora de AMP)

EC 6.3.2.2 glutamato—cisteína ligasa

EC 6.3.2.3 glutatión sintasa

EC 6.3.2.4 D-alanina—D-alanina ligasa

EC 6.3.2.5 Fosfopantotenato-cisteína ligasa (CTP)

EC 6.3.2.6 fosforibosilamino imidazolsuccinocarboxamida sintasa

EC 6.3.2.7 UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato—L-lisina ligasa

EC 6.3.2.8 UDP-N-acetilmuramato—L-alanina ligasa

EC 6.3.2.9 UDP-N-acetilmuramoilalanina—D-glutamato ligasa

EC 6.3.2.10 UDP-N-acetilmuramoilalanil-tripèptid—D-alanil-D-alanina ligasa

EC 6.3.2.11 carnosina sintasa

EC 6.3.2.12 dihidrofolato sintasa

EC 6.3.2.13 UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato—2,6-diaminopimelato ligasa

EC 6.3.2.14 enterobactina sintasa

EC 6.3.2.15 eliminada, transferida a EC 6.3.2.10

EC 6.3.2.16 D-alanina—alanil-poli(glicerolfosfato) ligasa

EC 6.3.2.17 tetrahidrofolato sintasa

EC 6.3.2.18 γ-glutamilhistamina sintasa

EC 6.3.2.19 eliminada, transferida a EC 6.2.1.45, :EC 2.3.2.23 and :EC 6.3.2.20 indoleacetato—lisina sintetasa

EC 6.3.2.21 eliminada, tran 6.3.2.49

EC 6.3.2.22 eliminada, transferida a EC 6.3.1.14

EC 6.3.2.23 homoglutatión sintasa

EC 6.3.2.24 tirosina—arginina ligasa

EC 6.3.2.25 tubulina—tirosina ligasa

EC 6.3.2.26 N-(5-amino-5-carboxipentanoil)-L-cisteinil-D-valina sintasa

EC 6.3.2.27 eliminada, transferida a EC 6.3.2.38 i EC 6.3.2.39

EC 6.3.2.28 L-aminoàcit α-ligasa

EC 6.3.2.29 cianoficina sintasa (L-aspartato-adding)

EC 6.3.2.30 cianoficina sintasa (L-arginina-adding)

EC 6.3.2.31 coenzima F₄₂₀-0:L-glutamato ligasa

EC 6.3.2.32 coenzima γ-F₄₂₀-2:α-L-glutamato ligasa

EC 6.3.2.33 tetrahidrosarcinapterina sintasa

EC 6.3.2.34 coenzima F₄₂₀-1:γ-L-glutamato ligasa

EC 6.3.2.35 D-alanina—D-serina ligasa

EC 6.3.2.36 4-fosfopantoato—β-alanina ligasa

EC 6.3.2.37 UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato—D-lisina ligasa

EC 6.3.2.38 N²-citril-N⁶-acetil-N⁶-hidroxilisina sintasa

EC 6.3.2.39 aerobactina sintasa

EC 6.3.2.40 ciclopeptina sintasa

EC 6.3.2.41 N-acetilaspartilglutamato sintasa

EC 6.3.2.42 N-acetilaspartilglutamilglutamato sintasa

EC 6.3.2.43 [proteïna lisW de la biosíntesis de lisina]—L-2-aminoadipato ligasa

EC 6.3.2.44 pantoato—β-alanina ligasa (ADP-formador)

EC 6.3.2.45 UDP-N-acetilmuramato L-alanil-γ-D-glutamil-meso-2,6-diaminoheptanodioato ligasa

EC 6.3.2.46 fumarato—(S)-2,3-diaminopropanoato ligasa

EC 6.3.2.47 dapdiamida sintasa

EC 6.3.2.48 L-arginina-específic L-amino acid ligasa

EC 6.3.2.49 L-alanina-L-anticapsin ligasa

EC 6.3.2.50 tenuazonato sintetasa

EC 6.3.2.51 fosfopantotenato—cisteína ligasa (ATP)

EC 6.3.2.52 jasmonoil—L-amino acid sintetasa

EC 6.3.2.53 UDP-N-acetilmuramoil-L-alanina—L-glutamato ligasa

EC 6.3.2.54 L-2,3-diaminopropanoato—citrato ligasa

EC 6.3.2.55 2-[(L-alanin-3-ilcarbamoil)metil]-3-(2-aminoetilcarbamoil)-2-hidroxipropanoato sintasa

EC 6.3.2.56 estafiloferrina B sintasa

EC 6.3.2.57 estafiloferrina A sintasa

EC 6.3.2.58 D-ornitina—citrato ligasa

EC 6.3.3 Cicle-ligasas

EC 6.3.3.1 fosforibosilformilglicinamidina cicle-ligasa

EC 6.3.3.2 5-formiltetrahidrofolato cicle-ligasa

EC 6.3.3.3 destiobiotina sintasa

EC 6.3.3.4 (carboxietil)arginina-β-lactama sintasa

EC 6.3.3.5 O-ureido-D-serina cicle-ligasa

EC 6.3.3.6 carbapenam-3-carboxilato sintasa

EC 6.3.3.7 Ni-sirohidroclorina a,c-diamida ciclasa reductiva

EC 6.3.4 Atres ligasas Carbono-Nitrogen

EC 6.3.4.1 eliminada, transferida a EC 6.3.5.2

EC 6.3.4.2 CTP sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.4.3 format—tetrahidrofolato ligasa

EC 6.3.4.4 adenilosuccinato sintasa

EC 6.3.4.5 argininosuccinato sintasa

EC 6.3.4.6 urea carboxilasa

EC 6.3.4.7 ribosa-5-fosfat—amonia ligasa

EC 6.3.4.8 imidazolacetato—fosforibosildifosfato ligasa

EC 6.3.4.9 biotina—[metilmalonil-CoA-carboxitransferasa] ligasa

EC 6.3.4.10 biotina—[propionil-CoA-carboxilasa (hidrolizante de ATP)] ligasa

EC 6.3.4.11 biotina—[metilcrotonoil-CoA-carboxilasa] ligasa

EC 6.3.4.12 glutamato—metilamina ligasa

EC 6.3.4.13 fosforibosilamina—glicina ligasa

EC 6.3.4.14 biotina carboxilasa

EC 6.3.4.15 biotina—(acetil-CoA-carboxilasa) ligasa

EC 6.3.4.16 carbamoil-fosfat sintasa (amonia)

EC 6.3.4.17 format—dihidrofolato ligasa

EC 6.3.4.18 5-(carboxiamino) imidazol ribonucleotide sintasa

EC 6.3.4.19 tARN-Ile-lisidina sintetasa

EC 6.3.4.20 7-ciano-7-deazaguanina sintasa

EC 6.3.4.21 nicotinato fosforibosiltransferasa

EC 6.3.4.22 tARN-Ile²-agmatinilcitidina sintasa

EC 6.3.4.23 format—fosforibosilaminoimidazol carboxamida ligasa

EC 6.3.4.24 tiramina—L-glutamato ligasa

EC 6.3.5.1 NAD⁺ sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.2 GMP sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.3 fosforibosilformilglicinamidina sintasa

EC 6.3.5.4 asparagina sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.5 carbamoil-fosfat sintasa (hidrolizante de glutamina glutamina)

EC 6.3.5.6 asparaginil-tARN sintasa (hidrolizante de hidrolising)

EC 6.3.5.7 glutaminil-tARN sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.8 eliminada, transferida a EC 2.6.1.85

EC 6.3.5.9 hidrógenobirinato, a,c-diamida sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.10 adenosilcobirato sintasa (hidrolizante de glutamina)

EC 6.3.5.11 cobirinato a,c-diamida sintasa

EC 6.3.5.12 Ni-sirohidroclorina a,c-diamida sintasa

EC 6.3.5.13 isoglutaminil lípit II sintasa (hidrolizante de glutamina)

Categoria EC 6.4 (forma enllaços C-C)

EC 6.4.1.1 piruvato carboxilasa

EC 6.4.1.2 acetil-CoA carboxilasa

EC 6.4.1.3 propionil-CoA carboxilasa

EC 6.4.1.4 metilcrotonoil-CoA carboxilasa

EC 6.4.1.5 geranoil-CoA carboxilasa

EC 6.4.1.6 acetona carboxilasa

EC 6.4.1.7 2-oxoglutarato carboxilasa

EC 6.4.1.8 acetofenona carboxilasa

EC 6.4.1.9 coenzima F430 sintetasa

Categoria EC 6.5 (forma éster fosfóricos)

EC 6.5.1.1 ADN ligasa (ATP)

EC 6.5.1.2 ADN ligasa (NAD⁺)

EC 6.5.1.3 ARN ligasa (ATP)

EC 6.5.1.4 ARN-fosfat-3'-terminal ciclasa (ATP)

EC 6.5.1.5 ARNfosfato -'-terminal ciclasa (GTP)

EC 6.5.1.6 ADN ligasa (ATP o NAD⁺)

EC 6.5.1.7 ADN ligasa (ATP, ADP or GTP)

EC 6.5.1.8 3'-fosfat/5'-hidroxi ligasa de àcit nucleicos

Categoria EC 6.6 (forma enllaços de coordinació d'un metal en ligantes de nitrogen)

EC 6.6.1 Formen complexos de coordinació

EC 6.6.1.1 magnesi quelatasa

EC 6.6.1.2 cobaltoquelatasa

Classificació

Les ligasas són classificades en sis subclasses en un sistema EC-número baix la categorisació de EC 6.-.-.-. El segon dígit definix la naturalea exacta de l'enllaç:

EC 6.1, inclou ligasas usades per a formar unions oxigen-carbono.
- EC 6.1.1 Ligasas formen aminoacil-ARNt i composts relacionats.
- EC 6.1.2 Ligasas àcit-alcohol (sintasas éster).
EC 6.2, ligasa usades per a formar unions carbono-sofre.
- EC 6.2.1 Ligasas àcit-tiol.
EC 6.3, inclou ligasas usades per a crear unions carbono-nitrogen.
- EC 6.3.1 Àcit-amoniaco (o amina) ligasas (sintasas amida).
- EC 6.3.2 Ligasas àcit-aminoàcits (pèptid sintasas).
- EC 6.3.3 Cicle-ligasas.
- EC 6.3.4 Atres ligasas carbono-nitrogen.
- EC 6.3.5 Carbono-nitrogen ligasas en glutamina com amido-N-donador.
EC 6.4, comprén ligasas que formen unions carbono-carbono.
EC 6.5, inclou ligasa que formen ésters fosfóricos.

EC 6.6, ligasa usades com a unió nitrogen-metal.
- EC 6.6.1 Formant complexos de coordinació.

Referències

↑ RANDOM HOUSE KERNERMAN WEBSTER’S COLLEGE DICTIONARY, Revised & Updated © 2010 K Dictionaries Ltd, by arrangement with Random House Information Group, an imprint of The Crown Publishing Group, a division of Random House, Inc. Copyright 2005, 1997, 1991 by Random House, Inc. All rights reserved.

Este artícul conté una traducció derivada de «Ligasa» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.

[1] RANDOM HOUSE KERNERMAN WEBSTER’S COLLEGE DICTIONARY, Revised & Updated © 2010 K Dictionaries Ltd, by arrangement with Random House Information Group, an imprint of The Crown Publishing Group, a division of Random House, Inc. Copyright 2005, 1997, 1991 by Random House, Inc. All rights reserved.

[1]