Avsunviroidae
Avsunviroidae és una família de viroides que en l'actualitat es classifiquen tres gèneros, que inclouen quatre espècies diferents de viroides.
Característiques
[editar | editar còdic]El seu genoma es compon d'un ARN en una llongitut d'aproximadament 246-375 nucleòtits. Este ARN és circular i monocatenario. Els círculs que forma són covalente i es produïx apareament de bases intramolecular. A excepció dels viroides de la família Pospiviroidae, tots els membres d'este grup carixen d'una regió conservada central.[1]
Infecten plantes i en 2019 es varen reportar infectant foncs,[2] encara que també han demostrat poder replicar-se en bactèries i algues.[3][4] Un estudi de metagenómica (2022) ha detectat molts ARN viroides no descoberts que infectarien foncs, procariota (estoves i bactèries) i eucariota unicelulars (algues uncelulares i protozoos), lo que sugerix que la diversitat d'este grup no s'ha descobert enterament.[5]
Replicació
[editar | editar còdic]La replicació es produïx en els cloroplastos en el cas de les plantes o algues, en atres hostes es produirà en el citoplasma. Les principals característiques de la replicació és que no necessita l'ajuda del virus ajudant, ni les proteïnes codificades per est, per a poder replicar-se. A diferència de l'atra família de viroides, Pospiviroidae, la família Avsunviroidae es replica a través del mecanisme de replicació en círcul rodante. Es creu que les cadenes positives de ARN són usades com a mòle per a formar #bri negatius en l'ajuda de l'enzima ARN polimerasa II. Les cadenes de ARN negatives són llavors escindides i circularizadas per l'activitat de la ribozima. Un segon mecanisme de círcul rodante forma un #bri positiu que també s'escindix per l'activitat de ribozima i despuix es lliga per a ser circular. El lloc de replicació és desconeguda, pero es creu que es dona en el cloroplasto i en presència dels cationes divalentes Mg2+
Estructura
[editar | editar còdic]Les prediccions d'estructura han sugerit que existixen com a molècules en forma de vareta en regions de emparejamiento de bases que provoquen la formació d'alguns bucles de forqueta o tenen configuracions ramificadas.
La família té quatre trams de nucleòtits conservats, guuuc, uc, ucag, C.Ade 5 'a 3', més els seus emparejamientos Watson-Crick en l'atre extrem del bucle. Açò és part de la seua ribozima martell. De lo contrari, hi ha poca similitut estructural en la família. No tenen els motius CCH, TCR o TCH conservats, que és una de les característiques que definixen la seua separació dels Pospiviroidae.
Taxonomia
[editar | editar còdic]Família Avsunviroidae
- Gènero Avsunviroid; inclou una única espècie Avocado sunblotch viroid
- Gènero Pelamoviroid; inclou una única espècie Peach latent mosaic viroid
- Gènero Elaviroid; inclou dos espècies; Chrysanthemum chlorotic mottle viroid i Eggplant latent viroid, sent esta última l'espècie tipo del gènero.
Detenció
[editar | editar còdic]La falta d'una llarga regió central conservada fa que Avsunviroidae siga més difícil d'identificar que Pospiviroidae. Un método per a detectar-los és usar el seu circularidad: una computadora pot juntar moltes llectures superpostes que semblen formar repeticions quan es coloquen linealmente.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Família Pospiviroidae [1] archivat en Wayback Machine.
- ↑ Shuang Wei, Ruiling Bian, Anada Bagus Andika, Erbo Niu, Qian Liu, Hideki Kondo (2019). Symptomatic plant viroid infections in phytopathogenic fungi [2] archivat en Wayback Machine.. PNAS.
- ↑ A Latifi. C Bernard, L Da Silva, I Andéolo (2016). Replication of avocado sunblotch viroid in the cyanobacterium Nostoc sp. PCC 7120 [3] archivat en Wayback Machine.. Journal Plant Pathology Microbiology.
- ↑ Diego Molina-Serrano, Loreto Suay, María L. Salvador, Ricardo Flores, José-Antonio Daròs (2020). Processing of RNAs of the Family Avsunviroidae in Chlamydomonas reinhardtii Chloroplasts [4] archivat en Wayback Machine.. American Society for Microbiology.
- ↑ Benjamin D. Lee, Uri Neri, Simon Roux, Yuri I. Wolf, Antonio Pedro Camargo, Mart Krupovic, RNA Virus Discovery Consortium, Peter Simmonds, Nikos Kyrpides, Uri Gophna, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin, (2022). A vast world of viroid-like circular RNAs revealed by mining metatranscriptomes. Biorxiv.
Bibliografia
[editar | editar còdic]- «MicrobiologyBytes: Viroids».Consultat el 16 de març de 2007.
- «Description of Plant Viruses- Avsunviroidae».Consultat el 16 de març de 2007.
- «STUDIES ON CATALYTIC RNA MOLECULES RELEVANT TO THE RNA WORLD HYPOTHESIS».
- Este artícul conté una traducció derivada de «Avsunviroidae» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.