Base de senyes química

Una base de senyes química és una base de senyes específicament dissenyada per a almagasenar informació química. Esta informació pot incloure fòrmules, estructures químiques i cristalines, espectres, reaccions químiques, síntesis químicas, i senyes termodinàmiques.

Tipos de bases de senyes químiques

Estructures químiques

Les estructures químiques es representen tradicionalment usant llínees que indiquen els enllaços químics entre els àtoms i dibuixades sobre paper (fòrmula estructural 2D. Mentres que estes són representacions visuals ideals per al químic, no són vàlides per a us computacional ni especialment para algoritme de busca i almagasenament informàtic. Les molècules chicotetes (també cridades ligandos en aplicacions de disseny de fàrmacs), es representen usualment usant llestes d'àtoms i les seues conexions. Les molècules grans com proteïnas es representen d'un modo més compacte usant seqüències d'aminoàcits, els seus blocs de construcció. Les grans bases de senyes químiques per a estructures són capaces de gestionar l'almagasenament i busca d'informació sobre millons de molèculas, ocupant terabytes de memòria física d'ordenador.

Bases de senyes de lliteratura científica

Les bases de senyes de lliteratura científica relacionen les estructures i una atra informació química en referències importants com a artículs pedagògics o palesos. Entre estes bases de senyes s'inclouen Chemical Abstracts Service STN i SciFinder o EBSCOhost. Els enllaços a cada publicació científica s'inclouen en moltes bases de senyes que se centren en les característiques químiques de cada substància.

Bases de senyes cristalográficos

Les bases de senyes cristalográficos almagasenen senyes de difracció d'estructures cristalines en rajos-X. Alguns eixemples d'estes bases són Protein Data Bank and Cambridge Structural Database.

Bases de senyes d'espectres de RMN

Les bases de senyes d'espectres de RMN relacionen estructures químiques en senyes de RMN. Estes bases de senyes inclouen a voltes atres característiques com a senyes d'espectroscòpia infrarroja de transformada de Fourier i d'espectres de masses.

Base de senyes de reaccions

La majoria de les bases de senyes químiques almagasenen informació sobre molècules estables pero en les bases de senyes de reaccions també s'arrepleguen composts intermijos i molèculas inestables de curta vida. Estes bases contenen informació sobre productes, eductos i mecanismes de reacció.

Bases de senyes termofísicos i termodinàmics

Les senyes termofísicos més importants es referixen a

• Equilibri de fases incloent equilibri líquit-vapor, solubilidad de gasos en líquits, i de líquits en sòlits, calors de dissolució, de vaporisació, i de fusió.
• Senyes calorífiques com calor específica, calor de formació i de combustió,
• Propietats de transport com viscosidad i conductivitat tèrmica

Bases de senyes de representació d'estructures químiques

Hi ha dos tècniques principals per a representar estructures químiques en bases de senyes digitals:

• Com a taules de conexió / matrius de adyacencia / llestes en informació adicional sobre enllaços (eixos) i els àtoms entre ells (nodos). Per eixemple:

  MDL Molfile, Protein Data Bank, Chemical Markup Language

• Com una notació de cordes llineals basada en distints algoritmes de busca. Per eixemple:

  SMILES/SMARTS, SLN, Wiswesser Line Notation, International Chemical Identifier (InChI)

Estos enfocaments s'han millorat per a permetre la representació de diferències estereoquímicas i espècies químiques en càrrega elèctrica aixina com tipos especials d'enllaç com els que apareixen en composts organometálicos. La principal ventaja d'una representació informàtica és la possibilitat de l'almagasenament elevat i les busques flexibles i ràpides.