L'àcit malónico és un àcit dicarboxílico simple, en dos grups carboxilo molt propencs en la seua molècula. En formar el malonato de dietilo a partir de l'àcit malónico, els grups hidroxilo (-OH) en abdós grups carboxilo són reemplaçats cada u d'ells per un grup etoxi (-OEt; -OCH2CH3). El grup metileno (-CH2-) en el mig de la part malónica de la molècula de malonato de dietilo té com a veïns a dos grups carbonilo (-C(=O)-).
Els àtoms d'hidrogen en el carbono adjacent al grup carbonilo en una molècula és llaugerament més àcit (pKa ≈19) que els àtoms d'hidrogen adjacents a un grup llogue. (Açò es coneix com la posició α respecte al carbonilo). Els àtoms d'hidrogen en el carbono adjacent a dos grups carbonilo són encara més àcits (pKa = 14), degut a que el grup carbonilo ajuda a estabilisar al carbanión resultant de l'eliminació d'un protón des del grup metileno que es troba entre els dos.
Este carbanión pot preparar-se tractant el malonato de dietilo en una base com l'etóxido de sodi en etanol. Si s'usa una solució d'hidròxit de sodi pot succeir la hidrólisis bàsica de l'éster, produint malonato de sodi i etanol. Quan s'usa etóxido de sodi, no obstant, qualsevol atac nucleofílico en el carboxilato pel etóxido no donarà productes colaterals. En conseqüència, es preferix el etóxido de sodi.
Este carbanión és neutralisat pel catión sodi del etóxido de sodi. La sal resultant és útil en la síntesis malónica.
Atres eixemples de composts 1,3-dicarbonilo en hidrogen lábiles inclouen l'acetilacetona i els éster acetoacetato. Sintéticamente, els éster malónicos són usats freqüentment en la condensació de Claisen, degut a que s'eviten reaccions de autocondensaciones indeseadas. Una atra reacció del malonato és la síntesis malónica, que forma un àcit acètic monosustituido:
